| Klimešová J. & Klimeš L. 2005: CLO-PLA: databáze architektury klonálního růstu rostlin střední Evropy. In: Klimešová J., Šmilauerová M. & Jakrlová J. (eds.) Podzemní orgány rostlin. - Zprávy České Botanické Společnosti, Praha, 40, Materiály 20, 53 - 64. |
| Klimešová J. & Martínková J. 2005: Intermediate growth forms as a model for the study of plant clonality functitioning: an example with root sprouters. Evolutionary Ecology 18, 669 - 681. |
| Klimešová J., Šmilauerová M. & Jakrlová J. 2005: Podzemní orgány rostlin. Zprávy Botanické Společnosti, Praha 40, Materiály 20, 2 - 159. |
| Lanta V. & Hazuková I. 2005: Growth response of downy birch (Betula pubescens) to moisture treatment at an cut-over peat bog in the Šumava Mts., Czech Republic. Annales Botanici Fennici 42, 247 - 256. |
| Navrátil J. & Navrátilová J. 2005: Prostorové změny v rozmístění vegetace v NPR Ruda (CHKO Třeboňsko) za posledních 20 let. In: Svatoňová H. (ed.) Geographicalk aspects of central European space, Sborník prací Pedagogické fakulty Masarykovy univerzity 183, 58 - 74. |
| Navrátilová J. & Hájek M. 2005: Recording relative water table depth using PVC tape discoloration: advantages and constraints in fens. Applied Vegetation Science 8, 21 - 26. |
| Navrátilová J., Husák Š, Adamec L. & Dvořáková K. 2005: Sbírka vodních a mokřadních rostlin Botanického ústavu AV ČR v Třeboni. Sborník z konference: Introdukce a genetické zdroje rostli, Botanické zahrady v novém tisíciletí, 85 - 92. |
| Navrátilová J. & Navrátil J. 2005: Vegetation gradients in fishpond mires in relation to seasonal fluctuations. Preslia 77, 405 - 418. |
| Prach K. 2005: Using spontaneous vegetation succession in restoration of limestone quarries in the Bohemian Karst. In: Annonymus: (ed.) Limestone quarring and sustainable development. Sprava CHKO Cesky kras., 23 - 26. |
| Průša D. & Adamec L. 2005: Aldrovanda vesiculosa L. Aldrovandka měchýřkatá. In: Chráněné rostliny České a Slovenské republiky. Computer Pres, Brno, 21 - 21. |
| Růžička V. & Klimeš L. 2005: Spider (Araneae) communities of scree slopes in the Czech Republic. Journal of Arachnology 33, 280 - 289. |
| Beneš J. & Prach K. 2004: Geobotanická indikace v archeologii. In. Kuna J. et al. : Nedestruktivní archeologie, 297 - 303. |
| Dolezal J., Ishii H., Vetrova VP., Sumida A. & Hara T 2004: Tree growth and competition in a Betula platyphylla-Larix cajanderi post-fire forest in central Kamchatka. Annals of Botany 94, 333 - 343. |
| Hubert J., Kučerová A. & Münzbergová Z. 2004: The comparison of orobatid mite (Acari: Orobatida) communities at various pathces in the seminatural meadow. 23, 328 - 341. |
| Husák Š. 2004: Substráty v rhizosféře šídlatek (Isoëtes) v šumavských jezerech. Aktuality šumavského výzkumu II. Aktuality šumavského výzkumu II. II., 129 - 131. |
| Janeček Š. 2004: Za přírodou Kamerunu I. Živa 1, 42 - 44. |
| Janeček Š. 2004: Za přírodou Kamerunu II. Živa 2, 89 - 92. |
| Janeček Š., Janečková P. & Lepš J., 2004: Influence of soil heterogeneity and competition on growth features of three meadow species. Flora 199, 3 - 11. |
| Jonášová M. & Prach K. 2004: Central-European mountain spruce (Picea abies (L.) Karst) forest: regeneration of tree species after a bark beetle outbreak. 23, 15 - 27. |
| Jongepierová I. Jongepier J.W. & Klimeš L. 2004: Restoring grasslands on arable land: an example of a fast spontaneous succession without weed-dominated stages. 76, 361 - 369. |